Nach Tätigkeiten als Assistenzarzt an der Landesheilanstalt Marburg sowie als Oberarzt an der Landesheilanstalt Haina wurde Theodor Malcus 1919 Direktor und Landesobermedizinalrat an der Landesheilanstalt Merxhausen. Diese Position übte er bis 1945 aus. Unter seiner Leitung wurden in Merxhausen Zwangssterilisationen durchgeführt sowie Patienten in die „Zwischenanstalten“ Eichberg und Herborn und weiter in die Tötungsanstalt Hadamar überstellt. Zwischen 1945 und 1947 war Malcus durch die Alliierten interniert worden. Anschließend lebte er wieder in Merxhausen.